中国农工民主党是以医药卫生界中高级知识分子为主的政党。1987年3月，海淀区第一个农工民主党基层组织海淀支部成立。孙美珂任主任委员，苏平任副主任委员，成员14人。1989年5月，海淀医院支部、北京分析仪器厂支部相继成立。孟昭光、李洪盛分别任两个支部的主任委员，成员26人。同年12月2日，农工党北京市海淀区工作委员会成立，主任委员孙美珂、副主任委员孟昭光、李洪盛，委员2人，下设3个支部，成员40人。1993年区工委换届，增补委员5人，支部4个，成员92人。同年农工北京市委将西苑医院支部（成员16人）划归农工海淀区工委。1994年9月中关村医院支部成立，成员14人。1998年1月，区工委换届，李洪盛任主任委员，乔岱峰、陈涵、杨彤林任副主任委员，委员5人。
2004年6月20日，农工民主党海淀区召开第一次代表大会，选举产生农工民主党海淀区第一届委员会，主任委员陈青云，副主任委员杨忠歧、陈涵、吕振华、杨彤林、刘平，秘书长由刘平兼任。
2006年7月，农工党海淀区召开第二次代表大会，选举产生了第二届区委领导班子，杨忠岐任主任委员，陈涵、吕振华、刘平、徐凤芹任任副主任委员。
2011年7月，农工党海淀区召开第三次代表大会，选举产生了第三届区委领导班子，徐凤芹任主任委员，段新芳、陆地、刘平、吴敏华、曹卫东任副主任委员。2012年7月，增补胡敏健为副主任委员。
2021年6月，农工党海淀区召开第五次代表大会，选举产生新一届领导班子，成员如下：
主任委员
曹卫东
中国农业科学院农业资源与农业区划研究所研究员、国家绿肥产业技术体系首席科学家
副主任委员
胡敏健（女）
农工党海淀区委会专职副主委
张盼月
北京林业大学环境科学与工程学院副院长
芮玉奎
中国农业大学资源与环境学院教授
肖京
中国中医科学院西苑医院康复医学科主任
姚云峰
北京肿瘤医院胃肠外科三病区副主任、感控科副主任
秘书长
魏明昭
农工党海淀区委会秘书长
农工党海淀区委联系电话：88487517